C-hepatiitin lääkehoidot ovat viime aikoina kehittyneet ja nykyisin C-hepatiitti pystytään parantamaan lähes kaikilta hoitoon hakeutuneilta. Aiemmin C-hepatiittia on hoidettu interferonilla, josta on tyypillisesti tullut runsaasti haittavaikutuksia. Nykyisin tautia hoidetaan tablettilääkkeillä, joiden sivuvaikutukset ovat vähäisiä.
Aiemmin C-hepatiitin hoidon esteenä on ollut huumeiden käyttö. Suomen hepatiittistrategiassa vuoden 2018 tavoitteena on laajentaa hoito korvaushoitopotilaisiin hyvien toimintamallien luomiseksi. Lisäksi uuden C-hepatiittistrategian tavoitteena on mm. testaus- ja hoitokäytäntöjen yhdenmukaistaminen sekä C-hepatiittitartunnan saaneiden saattaminen kattavasti seurannan ja hoidon piiriin. Pitkän aikavälin tavoitteena on hoitaa kaikki C-hepatiitin kantajat maksavaurion asteesta riippumatta.
C-hepatiittiin on olemassa lääkehoito, jolla virus voidaan häätää elimistöstä. Hoito kestää yleensä 12 viikkoa. Hoitoon tarvittavan lähetteen saa omalta terveysasemalta.